AVOGADRO

AVOGADRO Software Pada  Kimux

Avogadro adalah software kimia gratis, open source, tersedia dalam berbagai paltform sistem operasi merupakan editor molekul yang dirancang untuk digunakan secara fleksibel dalam kimia komputasi, pemodelan molekul, bioinformatika, ilmu material, dan bidang terkait lainnya. Avogadro yang tersedia dapat dijalankan pada sistem Windows, Linux, dan Mac OS X. Kode sumber sumber tersedia di bawah GPL GNU. Menurut saya aplikasi ini sangat bagus dengan kelebihan ukuran filenya sangat kecil (tidak lebih dari 10 MB). Tampilan yang bagus dan sudah bisa dihandle oleh perangkat keras kebanyakan sekarang.

Apa yang dapat dilakukan Avogadro?

Dapat melakukan pengunduhan secara langsung dari PDB (protein data bank) atau PubChem (database dari molekul  kimia dan aktivitasnya terhadap uji biologis)

Inovatif “auto-optimation”, alat yang memungkinkan Anda untuk terus membangun dan memodifikasi, selama optimasi mekanika molekular.

Antarmuka untuk banyak paket komputasi umum.

Plugin yang memungkinkan Avogadro untuk diperpanjang dan disesuaikan.

Embedded interpreter Python.

Terjemahan tersedia dalam 19 bahasa lebih, termasuk antar muka juga sudah bisa berbahasa Indonesia, tersisa hanya beberapa bagian saja yang belum dialihbahasakan.

Cross-Platform : Molekul pembangun / editor untuk Windows, Linux, dan Mac OS X.

Intuitif : Dibangun untuk dapat digunakan dengan mudah bagi mahasiswa dan peneliti lebih lanjut.

Cepat : Mendukung multi-threaded rendering dan komputasi.

Extensible : Plugin arsitektur bagi pengembang, termasuk rendering, tool interaktif, perintah, dan skrip Python.

Fleksibel : Fitur OpenBable yang dapat digunakan untuk impor file-file kimia lain, input untuk beberapa paket kimia komputasi, kristalografi, dan biomolekul.

Sumber untuk men-download silahkan klik di : DOWNLOAD

Tutorialnya dapat dilihat atau diunduh dari sini. Ada juga tutorial dalam bentuk videonya, silahkan kunjungi

http://avogadro.openmolecules.net/wiki/Tutorials

Software ini adalah hasil proyek komunitas dengan banyak kontributor, makanya disebut open source, siapapun boleh memberikan umpan balik, melaporkan bug dan kode agar menjadi lebih baik.

Karena ukurannya yang sangat kecil dan tidak terlalu memerlukan hardware dengan spek yang tinggi dan mahal maka sangat cocok digunakan saat pelajaran kimia pada materi-materi tertentu, dapat digunakan secara langsung di kelas. Tentu kita harus memahami berbagai seluk-beluknya. Ini adalah alternatif pembelajaran yang mengajak siswa mengamati secara langsung proses dan sifat kimia suatu zat.

Avogadro adalah molekul editor canggih yang dirancang untuk cross-platform yang digunakan dalam kimia komputasi, pemodelan molekul, bioinformatika, ilmu material, dan bidang terkait. Menawarkan render fleksibel dan arsitektur plugin yang kuat.

Sementara masih dalam versi beta, 0,8 rilis terakhir membawa kegunaan umum untuk melihat dan mengedit molekul pada Mac Anda. Anda dengan cepat dapat mengekspor grafis ke PNG, JPEG, atau bahkan POV-Ray render, atau menyalin dari editor dan paste ke PNG transparan program-program seperti OmniGraffle. Avogadro mendukung membaca dari lebih dari 80 format file yang kimia, milik perpustakaan Babel Terbuka.

Saat ini fitur berpusat pada bangunan molekul interaktif dan pengeditan molekul kecil. Sebuah “auto-mengoptimalkan” alat akan melakukan optimasi geometri molekul mekanik di latar belakang saat Anda mengedit, dan “menyesuaikan hidrogen” fitur memungkinkan untuk cepat “mematung” molekul baru.

Karena Avogadro adalah multi-threaded, visualisasi ikatan hidrogen atau jenis display lainnya adalah dinamis. Sebagai contoh, selama optimasi geometri, kita dapat melihat gaya yang bekerja pada setiap atom (panah hijau) serta pembentukan dan memecah ikatan hidrogen (garis putus-putus putih).

Rencana masa depan untuk versi Mac Avogadro termasuk integrasi Spotlight dan QuickLook, serta built-in scripting dengan Python. Pekerjaan juga dilakukan untuk memungkinkan copy / paste dari ChemDraw dan aplikasi kimia lainnya 2D menggambar. Pembangun tambahan (misalnya, untuk biomolekul, nanotube, dan nanopartikel) dan interface untuk paket lainnya kimia komputasi adalah karena untuk versi masa depan juga.